当前位置:首页 > 五谷养生 > 阅读详情

中国科学家完成谷子的全基因组测序

发布时间:2012-08-22 20:54:23    来源:小米网    阅读次数:16235

谷子是重要的禾本科作物之一,其脱壳前被称为谷子,脱壳后被称为小米,是中国古代最重要的粮食作物,被称为“五谷之首”。深圳华大基因和张家口农科业院等单位合作完成谷子基因组测序,并构建了谷子全基因组序列图谱,谷子基因组大小约为470Mb。为揭示谷子抗旱节水、丰产、耐瘠和高光合作用效率等生理机制的研究,以及高产优质、抗逆谷子新品种的培育奠定了坚实的基础。

2012年5月14日,由深圳华大基因研究院和张家口市农业科学院等单位合作完成的谷子基因组研究成果于国际著名杂志自然-生物技术(nature biotechnology)上在线发表。在本研究中,科研人员成功构建了谷子全基因组序列图谱,为揭示谷子抗旱节水、丰产、耐瘠和高光合作用效率等生理机制的研究提供了新的途径,并为高产优质、抗逆谷子新品种的培育奠定了坚实的基础。

谷子基因组研究
▲谷子基因组研究

随着水稻、玉米、高粱、短柄草等重要禾本科物种的基因组相继被解密,科研人员更加迫切地希望能够破解更多的重要禾本科作物基因组,以期能揭示重要禾本科作物的保守性及差异性、阐明禾本科作物的基因组进化过程、进一步挖掘作物重要性状功能基因。谷子是重要的禾本科作物之一,其脱壳前被称为谷子,脱壳后被称为小米,是中国古代最重要的粮食作物,被称为“五谷之首”,从南到北均曾被广泛种植。谷子是二倍体自花授粉作物,其基因组较小(约470 Mb),具有丰富的遗传多样性(约6000个品种),种质资源保存较完整。此外,它还具有生育期短、单株籽粒多、适应性广、抗旱、耐瘠、采用C4光合途径等特点。这些特性使谷子能够成为一个很好的抗旱机理及C4光合系统发育与调控研究的新模式作物。

华大基因
▲华大基因

这次的测序是通过新一代测序技术完成的,华大基因的科研人员对一个来自中国北方的谷子品系(zhang gu)进行了全基因组测序和组装,并获得了谷子的全基因组序列图谱(组装得到的基因组大小约为423Mb,N50达到了1.0Mb)。通过基因组注释和分析发现,谷子基因组中的重复序列约占整个基因组的46%,大约含有38801个蛋白质编码基因。同时,研究人员还对另一谷子品系A2进行了重测序(10X基因组),利用zhang gu和A2的F2群体绘制了高密度的遗传图谱,为谷子基因组的组装、谷子性状的研究奠定了基础。例如,通过将谷子的基因组序列、遗传图谱及其后代表型等信息相结合,研究人员准确地找到了谷子中与抗稀禾定(一种除草剂)性状相关的基因,印证了之前研究表明的一个单核苷酸突变位点(SNP)可能是导致植株对稀禾定敏感性发生改变的结论。

谷子和水稻大约在5000万年前开始分化,分化之后的基因组结构仍存在明显的共线性。研究人员发现谷子的2号和9号染色体分别由水稻的7号和9号、3号和10号染色体融合而成。同时,他们发现这两次融合事件也发生在高粱的染色体中,由此,研究人员推测这两次染色体融合事件应该发生在谷子和高粱分化之前。此外,研究人员还发现了谷子独立分化出来之后的一次特异性染色体融合事件,即谷子的3号染色体是由水稻的5号和12号染色体或高粱的8号和9号染色体融合而成。这些染色体重组事件是物种遗传变异及物种分化的重要基础。

谷子属于C4植物,与C3植物(如水稻和小麦)相比具有较高的水分利用效率和光合效率。为了揭示C4植物和C3植物在光合作用过程中遗传机制上的差异性,研究人员对谷子中与光合作用有关的重要基因进行了分析,发现C4植物和C3植物均有与碳固定途径有关的基因且相关基因在拷贝数目上的变化差异不大。由此,他们推测C4植物中的C4途径可能是由于调控表达的差异所引起的功能上的改变导致的。

谷子植物
▲谷子植物

在全球气候剧烈变化、耕地资源不断减少、水资源日益短缺的情况下,大力培育和推广优良谷子品种将有助于提高土地利用率,节约灌溉用水,增加粮食产量,合理膳食结构,改善人民健康。华大基因研究院副院长张耕耘表示:“谷子全基因组序列图谱的完成是进行禾本科比较基因组学研究和功能基因挖掘的重要进展。此外,谷子基因组数据为谷子的生物学研究和新品种选育提供了一个全新的支撑平台。

目前,水稻、玉米、高粱、短柄草等禾本科植物的全基因组已经被相继破译,谷子全基因组序列的获得,为阐明禾本科植物的基因组进化过程具有重要的参考价值,为进行禾本科比较基因组学研究和功能基因挖掘提供重要信息。

文 《自然—生物技术》

展开全部内容
文章地址:http://www.huangxiaomi.net/topic/gv16q0.html
已有0条评论>>参与评论

* 请自觉遵守政策法规,文明发言。

相关内容
  • 山西为小杂粮立法 打造优势品牌

    山西为小杂粮立法 打造优势品牌

    7月22日,山西人大审议通过了全国第一部小杂粮产业方面的地方性法规《山西省小杂粮保护促进条例》,对于打好山西小杂粮优势牌、推动山西小杂粮产业提质增效具有重要意义。品牌建设以及规范化管理是山西小杂粮发展的短板,做优做强山西小杂粮品牌。立足优势,扬长避短,突出“特”字,发展现代特色农业,是小杂粮立法的根本遵循。

  • “健康是1,其他是后面的0”

    “健康是1,其他是后面的0”

    健康是1后面是0的名言是谁说的?健康是1后面是0的原句是“人民的幸福生活,一个最重要的指标就是健康,健康是1,其他是后面的0。”习总书记强调,全民健身是全体人民增强体魄、健康生活的基础和保障。

  • 史上最全的粥谱:百年粥店的秘密都在这啦!

    史上最全的粥谱:百年粥店的秘密都在这啦!

    本文整理了五十五款粥品的原料、制作方法及功效信息,堪称史上最全的粥谱、煮粥食谱大全,包含了皮蛋瘦肉粥、八宝粥、百合红枣粥、山药粥、甘草绿豆粥、小米红糖粥、红枣莲子粥、虾仁米粥、苹果麦片粥、脊肉粥、莲子桂圆粥等。读者可以根据个人口味、季节和功效来熬制各种自己喜爱的粥。

  • 中原农业起源与文明崛起 粟和黍适合处女地上播种

    中原农业起源与文明崛起 粟和黍适合处女地上播种

    中原农业起源起源于黄土与粟。黄河流域的狗尾草和野糜子耐干旱耐贫瘠,适应性强,在中国先民栽培下,狗尾草进化成了粟,俗称谷子,野糜子进化成了黍,也称作糜子。粟和黍被统称为小米。早期主要种植黍,后来粟成为主粮。小米和水稻养育了中国先民。尤其是小米,耐旱耐贫瘠,便于长时间储藏,在很长历史时期是北方主要粮食作物,对中原地区文明崛起发挥了最关键的作用。

热门内容
最新发布

Copyright © 2024  www.huangxiaomi.net  小米网   版权所有“黄小米,大产业!”   联系邮箱:xiaomichanye@qq.com(商务合作

关于我们   国家工信部备案:晋ICP备2023017507号-1违法和不良信息举报温馨提示:信息仅供参考,不作为消费、医疗依据。

百度 360网站安全检测

隐藏客服 咨询客服